Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CRTAC1Q9NQ79 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAC1Q9NQ79 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms