Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP13A2Q9NQ11 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP13A2Q9NQ11 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms