Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4BQ9NPR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4BQ9NPR2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms