Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED4Q9NPJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED4Q9NPJ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms