Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD3Q9NPG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms