Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNB1IP1Q9NPC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms