Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MID1IP1Q9NPA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms