Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRHQ9HD43 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRHQ9HD43 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRHQ9HD43 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRHQ9HD43 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRHQ9HD43 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRHQ9HD43 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms