Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F12Q9HCS2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F12Q9HCS2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms