Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMURF1Q9HCE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms