Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKRIP1Q9H875 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKRIP1Q9H875 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms