Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C11orf49Q9H6J7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms