Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XKR8Q9H6D3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms