Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4AQ9H3S1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4AQ9H3S1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms