Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS16Q9H269 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS16Q9H269 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms