Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG9Q9H0W8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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