Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM49AQ9H0Q0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM49AQ9H0Q0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms