Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK2Q9H0K1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK2Q9H0K1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms