Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL25Q9H0H3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL25Q9H0H3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms