Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKRN2Q9H000 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms