Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSP1Q9GZU7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms