Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC90BQ9GZT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms