Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms