Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80BQ9C086 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms