Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM8Q9BZR9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM8Q9BZR9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms