Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
YTHDF1Q9BYJ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms