Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSPO3Q9BXY4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSPO3Q9BXY4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms