Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRIP1Q9BX63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms