Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBB2BQ9BVA1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms