Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDC1Q9BTX1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms