Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM43Q9BTV4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms