Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MXRA8Q9BRK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MXRA8Q9BRK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
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