Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C20orf78Q9BR46 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms