Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOXF2Q9BQY4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms