Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL2Q99962 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL2Q99962 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms