Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3AQ99856 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms