Protein–RNA interactions for Protein: Q99733

NAP1L4, Nucleosome assembly protein 1-like 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L4Q99733 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAP1L4Q99733 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAP1L4Q99733 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L4Q99733 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms