Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1Q99675 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGRRF1Q99675 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms