Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAT1Q99536 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAT1Q99536 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms