Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms