Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAPLN3Q96S86 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAPLN3Q96S86 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms