Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms