Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CITED4Q96RK1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED4Q96RK1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms