Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TEFMQ96QE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms