Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIM3Q96PE6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms