Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA13Q96N96 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA13Q96N96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms