Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROBO3Q96MS0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
ROBO3Q96MS0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms