Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms