Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM20AQ96MK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms