Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMTD1Q96MG8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms